Yeni teknoloji, yüzlerce proteini tek bir örnekte algılayabilir

Anonim

McGill Üniversitesi bilim adamlarından oluşan bir ekip tarafından geliştirilen yeni teknoloji, hastanelerin ve araştırma laboratuvarlarına benzer şekilde hızlı, yüksek hacimli ve düşük maliyetli bir araç sunan, protein analizlerini hızlandırma potansiyeli göstermektedir.

Kanda bulunan proteinler, sağlığımız hakkında önemli bilgilerle bilim insanlarına ve klinisyenlere sağlar. Bu biyolojik belirteçler, bir göğüs ağrısının bir kardiyak olaydan mı kaynaklandığını veya bir hastanın kanseri olup olmadığını belirleyebilir.

Ne yazık ki, bu tür proteinleri saptamak için kullanılan araçlar son 50 yılda çok fazla gelişmemiştir - vücudumuzda 20.000'den fazla protein olmasına rağmen, günümüzde uygulanan protein testlerinin büyük çoğunluğu, sadece tek bir proteini hedeflemektedir.

Şimdi doktora McGill'in Biyomedikal Mühendisliği Bölümü'nden Profesör David Juncker ve meslektaşlarından Milad Dagher, tek bir kan örneği ile yüzlerce proteini tespit edebilecek bir teknik geliştirdiler.

Nature Nanotechnology'de yayınlanan çalışmalarının bir kısmı, çok renkli floresan boyalar kullanarak mikro boncukları barkodlamak için yeni ve geliştirilmiş bir yol tarif ediyor. 500 farklı renkli mikro-boncukların yukarı doğru üretilmesiyle, yeni barkodlama platformu aynı çözümden paralel olarak işaretleyicilerin tespit edilmesini mümkün kılar - örneğin kırmızı bir barkod işaretleyici 2'yi algılayabilirken, işaretçi 1'i tespit etmek için mavi bir barkod kullanılabilir. yakında. Bir sitometre olarak adlandırılan lazer tabanlı bir alet, farklı renkli boncuklara yapışan proteinleri sayar.

Bu tür bir analiz metodu bir süredir mevcut olmasına rağmen, çok renkli boyalar arasındaki etkileşim doğru renkleri üretme kabiliyetini sınırlamıştır. Şimdi, ekip tarafından geliştirilen yeni bir algoritma, farklı renkte mikro-boncukların yüksek doğrulukla üretilmesini sağlıyor - renk karıştırmasının sonucunu tahmin etmek için bir renk tekerleği gibi kullanılabilir.

Profesör Juncker'ın ekibi, proteinlerin daha iyi analiz edilmesi için platformundan yararlanmayı umuyor.

Dagher, "Mevcut teknolojiler, bir kerede ölçülebilen protein sayısı ile bir testin maliyeti ve doğruluğu arasında büyük bir değiş tokuş tutuyor" diye açıklıyor. "Bu, klinik denemeler gibi büyük ölçekli çalışmaların yetersiz yeteneklere sahip olduğu için denenmiş ve gerçek platformlara geri dönme eğilimi gösterdiği anlamına geliyor."

Gelecekteki çalışmaları, artan ölçek ile proteinlerin doğru şekilde tespit edilmesine odaklanıyor.

"Ensemble çok renkli FRET modeli aşırı FRET seviyelerinde barkodlama sağlar" Milad Dagher, Michael Kleinman, Andy Ng ve David Juncker tarafından Nature Nanotechnology'de yayınlandı.

menu
menu